Munissez-vous de papier et stylo.

Soit le tri-peptide de séquence AHV.

Combien d'atomes donneurs de liaisons hydrogène sont présents au total sur la molécule si tous ses groupements chimiques ionisables se trouvent dans leur forme ionisée ?

Le récepteur Rtk8Q est une protéine structurée en deux domaines, dont un domaine membranaire (inséré dans la membrane plasmique de la cellule) et un domaine extra-cellulaire (exposé sur la surface extérieure de la membrane). Un échantillon purifié de cette protéine est soumis à une fragmentation ménagée par des protéases, puis les fragments sont séquencés. Les séquences de quelques fragments sont reportées ci-dessous.

Lequel des fragments appartient au domaine membranaire de la protéine Rtk8Q ?

Soit le peptide de séquence :

CLLUEFUNPPDRGULIU

Combien de groupes chimiques qui portent des électrons conjugués contient cette molécule lorsqu'elle se trouve à pH 7 ?

Pour rappel : les trois diagrammes de Ramachandran discutés en cours sont reportés ci-dessous.

Des chercheurs ont résolu la structure tertiaire de la protéine Rat2B

par diffraction de rayons X. Ils s'intéressent en particulier à la conformation d'une boucle (résidus 248–251) qui est censée interagir avec des anticorps. Les chercheurs décrivent

la conformation observée pour cette boucle comme suit :

————Gly_248————Glu_249————Pro_250————Gly_251————

D'après ces informations, que peux-t-on dire sur la conformation de cette boucle ?

À quel pH cet acide aminé se trouvera majoritairement sous cette forme (c.-à-d. avec ses groupes acides/basiques dans l'état de charge représenté dans la figure) ?