Неможливість використання довгих шляхів до директорій

Значні втрати простору через внутрішню фрагментацію (хвости файлів)

Зменшення швидкості послідовного зчитування даних

Тільки обмеження кількості символів у назвах файлів

Автоматичне пошкодження магнітного шару поверхні диска