WireGuard tidak dapat digunakan untuk koneksi Site-to-Site, sehingga performanya tidak relevan untuk perusahaan.

WireGuard memiliki basis kode yang jauh lebih kecil dan modern, sehingga lebih mudah diaudit keamanannya dan seringkali lebih cepat.

WireGuard lebih lambat karena hanya menggunakan enkripsi asimetris untuk semua transfer data.

IPsec selalu lebih cepat karena didukung oleh akselerasi perangkat keras (hardware acceleration) di hampir semua router.