Archivo que contiene información sobre las posiciones del genoma y las secuencias que han leído esa posición. Se genera con el comando samtools mpileup

Información de la localización de cada secuencia en el genoma de referencia en codificación de texto universal

Secuencias de cada uno de los fragmentos introducidos en el secuenciador

Versión binaria del archivo sam que necesita herramientas específicas para su lectura y manipulación

Listado de mutaciones encontrados en una o varias muestras

Versión binaria del archivo vcf que necesita herramientas específicas para su lectura y manipulación