Збільшити регуляризацію, бо надмірна впевненість завжди означає перенавчання.

Просто зменшити поріг прийняття рішення, бо це виправляє проблему некаліброваних ймовірностей.

Виконати калібрування ймовірностей, наприклад temperature scaling або Platt scaling, щоб узгодити predict_proba() з реальними частотами.

Перенавчити модель із логарифмічними шансами як цільовою змінною, бо це автоматично усуне надмірну впевненість.