Нічим – результати завжди однакові

wscript.exe потребує прав адміністратора, а cscript.exe ні

cscript.exe може запускати тільки VBScript, а wscript.exe – тільки JScript

wscript.exe відображає вихідні повідомлення (WScript.Echo) у графічних діалогах, тоді як cscript.exe – у консолі