В отличие от характеристик дополнительные реквизиты хранят информацию только о стоимости товара

Дополнительные реквизиты нельзя редактировать после создания товара в отличие от характеристик

Дополнительные реквизиты можно создать единожды для одного вида номенклатуры, а создание характеристик неограниченно

Дополнительные реквизиты номенклатуры можно считать дополнительным описанием товара. Характеристики же являются уточнением определенного товара