La asepsia emplea soluciones de clorhexidina y povidona yodada, mientras que la antisepsia utiliza autoclave de vapor.

La asepsia busca la ausencia de microorganismos en objetos inanimados mediante barreras, mientras que la antisepsia destruye o inhibe microorganismos en tejidos vivos.

La asepsia se enfoca exclusivamente en tejidos vivos y la antisepsia en objetos inanimados.

La antisepsia asegura la eliminación total de esporas bacterianas, mientras que la asepsia solo destruye bacterias vegetativas.