Previene la salida al organismo de células inmunes con alta afinidad por antígenos propios.

En el timo, los timocitos autorreactivos de alta afinidad sufren deleción clonal.

Ocurre exclusivamente después del nacimiento, cuando el sistema inmune empieza a exponerse a antígenos ambientales.

La expresión del factor AIRE en el timo permite la presentación de antígenos tisulares periféricos.

La presentación de antígenos propios en médula ósea induce edición de receptores en linfocitos B.