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MGIN 3h Praxis - Medizin- und Gesundheitsinformatik - 5AHBGM - SJ2627

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Wie oft kommt das Motiv KTKEGV im menschlichen α-Synuclein NP_000336.1 vor? (ganze Zahl)

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Wie viele Aminosäuren hat das menschliche β-Synuclein NP_001001502.1, geholt über die NCBI-E-utilities? (ganze Zahl)

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Wie viele Reads bleiben mit der Regel „mittlerer Phred ≥ 25 und Länge ≥ 100“? (ganze Zahl)

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Lade dein ausgeführtes Notebook MGIN3-E02-zweiter-strang.ipynb hoch (alle Zellen mit Output) und schreib in zwei Sätzen, warum ein ORF mit über 60 Codons noch kein Gen ist.

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Länge des übersetzten Proteins in Aminosäuren, ohne Stop (ganze Zahl)

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Wie viele Reads enthalten mindestens ein N? (ganze Zahl)

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Startposition des längsten ORFs (1-basiert, auf dem −-Strang im reversen Komplement gezählt) (ganze Zahl)

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Länge des längsten ORFs auf beiden Strängen, in Codons inklusive Stop (ganze Zahl)

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Länge des längsten ORFs auf dem +-Strang allein, in Codons inklusive Stop (ganze Zahl)

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Auf welchem Strang liegt der längste ORF von archiv_fragment.fasta?