Неможливо повторно використати сирі дані без повторного звернення до джерела.

З’являється ще один рівень пайплайна, який треба проектувати, моніторити й очищувати.

Можливе дублювання частини production-даних для development/test-перевірок.

Неможливо реалізувати аудит і логування етапів процесу.

Додатковий етап може збільшувати latency.

За великого проміжку між Extract і Load дані можуть втратити актуальність.

Потрібен механізм очищення застарілих проміжних даних.

Потрібне додаткове місце для staging-таблиць або файлів.