Se pueden alinear frente al genoma de referencia tanto con BWA como con HISAT2.

Es mejor alinearlos con BWA porque es un alineador mucho más eficiente

Los datos de RNA-seq no se alinean frente al genoma de referencia nunca. 

Es necesario alinearlos con HISAT2 porque los datos de RNA-seq son mucho más pesados y BWA no puede con ellos.

Se deben alinear con HISAT2 para alinear bien las lecturas que contienen splicings.

4C

ATAC-Seq

Ninguna de las anteriores

ChIP-seq

Hi-C

Las respuestas b y c son correctas.

Implican necesariamente el aislamiento mediante FACs de células aisladas.

Son técnicas en fase experimental que todavía no están disponibles para los proyectos de investigación.

Tienen una menor sensibilidad que las técnicas tradicionales para detectar cambios presentes en poblaciones de células minoritarias.

Permiten identificar los cambios de expresión de células individuales

Todas las plataformas se basan en la unión de fragmentos de DNA a un soporte sólido

Cualquier librería puede ser secuenciada en cualquier plataforma de secuenciación porque todas tienen las mismas secuencias adaptadoras

Las distintas plataformas de secuenciación presentan diferencias en la cantidad y longitud de secuencias generadas

Todas las plataformas de secuenciación masiva generan miles de secuencias cortas (100-300 pb) en una única reacción

Todas las plataformas de secuenciación masiva se basan en la copia del ADN mediante una ADN polimerasa