Kui palju selle faagi genoomist lisati tuumgenoomijoondusesse?

Milline analüüsitud faagidest on kõike pikema genoomiga? Pange kirja selle faagi nimi, mitte ainult ID.

Joondage genoomid, kasutades referentsina andmebaasist alla laetud järjestust ning kahte protsessorituuma. Oluline on saada lõppanalüüsi kõik genoomid. Milline on tulemuskataloogi nimi ja asukoht serveris (märkige ka oma kodukataloogi nimi)? 

Kui referentsgenoomi järjestuse hankimine ebaõnnestus, laske programmil referents valida juhuslikult.

Kui suur osa genoomist lisati tuumgenoomijoondusesse kõigist analüüsitud genoomidest keskmiselt?

Kasutades blastdbcmd käsu võimalusi salvestage see geen assambleeritud genoomi failist eraldi faili koos startkoodonile eelneva 10 nukleotiiga. Salvestage fail formaadiga sobiva faililaiendiga. Milline oli käsurida? 

Mis on selle geeni lõppkoordinaat kontiigis?

Mis on selle geeni startkoodoni alguskoordinaat kontiigis?

Kui pikk see geen on ning kas see on 100% identne andmebaasi järjestusega või mitte?

Valige eelmise küsimuse kolme geeni hulgast kõige pikem ja genoomis täielikult olemasolev geen. Millises kontiigis see geen antud assembly’s paikneb?

Millised nimetatud resistentsusgeenidest on tüve KP03 genoomis olemas ning kas täielikult või osaliselt?

a. blaLAP-2

b. aadA3

c. qnrS1