Crowdly
Add to Chrome
Bioinformaatika II (LOMR.10.005)
Looking for Bioinformaatika II (LOMR.10.005) test answers and solutions? Browse our comprehensive collection of verified answers for Bioinformaatika II (LOMR.10.005) at moodle.ut.ee.
Get instant access to accurate answers and detailed explanations for your course questions. Our community-driven platform helps students succeed!
Milline on keskmine sekveneerimissügavus pärast lugemite puhastamist? Näidake arvutuskäik.
Milline oli keskmine lugemipikkus pärast filtreerimist (eraldi forward ja reverse lugemitel)?
Kui palju lugemeid jäi filtreerimise tõttu paariliseta? Näidake lahenduskäik, kuidas vastuseni jõudsite.
Mitu protsenti lugemitest puhastamise käigus eemaldati?
Puhastage lugemid programmiga fastp kasutades
- minimaalset lugemipikkust 110 bp
- cut_front ja cut_right lõikamist vaikimisi väärtustega
- eemaldage võimalikud sekveneerimisadapterid ning
- salvestage eraldi faili(desse) ka kvaliteetse paariliseta jäänud lugemid.
Milline oli kasutatud käsurida?
Milline on keskmine sekveneerimissügavus? Näidake arvutuskäik.
Kui palju lugemeid on kokku?
Analüüsige toorlugemeid programmiga fastp.
Kui pikad lugemid on soovitud sekveneerida ja milline oli tegelik saavutatud keskmine lugemipikkus?