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3) Combien d'individus homozygotes pour l'allèle A recensez-vous à la position 147160 parmi les 41 premiers individus (il y a en effet 41 individus dans les 50 premières colonnes)?
11 ) En utilisant la méthode de comptage de votre choix, déterminez le nombre de variants présent dans BRCA1 au sein de la cohorte 1k genome.
7) A votre tour de compter le nombre d'insertions/délétions présentes.
Par quoi remplacer XXX dans la commande suivante ?
zcat ./data/chr17.vcf.gz | grep -c "XXX"
9 ) En additionnant ce dernier chiffre au nombre de SNP et d'INDEL, obtenons-nous le même qu'avec la commande wc -l ?
5 ) Combien de lignes comporte le fichier ./data/chr17.vcf.gz ?
14 ) Vous allez maintenant effectuer les même opérations que précédemment sur le chromosome 17 entier.
EAS (Est-Asiatique)