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PA02E190 Analyse de données scientifiques

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  4 ) Placez à la fin de la ligne la commande permettant d'obtenir le nombre de ligne (uniquement !) du fichier vcf du chromosome 17

cat ./data/chr17.vcf.gz | gzip -d | XXX

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12 ) Répétez exactement la même opération pour le SNP rs799923
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8 ) Combien avez vous recensé d'INDEL ?

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Pour extraire les 3 premières positions d'un vecteur v5 de longueur 10, la commande est :

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Quel résultat obtient-on avec l’enchainement de ces commandes?

v6 <- c(1,10,100, 1000)

v6 <- c(v6[1]*10,v6[3])

v6

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Quelle commande me permet de vérifier que le vecteur v2 de la question précédente contient bien une chaîne de caractères ?

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Quel résultat donne l’enchainement des commandes suivantes ?

a <- 10

b <- a /2

a <- 20

b

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Quelle commande permet de générer le vecteur v3 contenant la chaîne de caractères "un chat a 7 vies" :

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Quel résultat donne la commande suivante ?

rep(seq(1, 10, 2), 2)

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Quelles commandes permettent de créer un vecteur v4 contenant les valeurs numériques 34, 45, 65 et 46 puis de trier ses valeurs par ordre croissant ?

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